Es importante cortar el eneldo solo cuando el tiempo sea seco y no haya llovido anteriormente. Las hojas y los tallos se cosechan cuando la planta alcanza unos 25 cm. de altura.Se puede utilizar fresca ó en manojos, guardarse en la nevera para su uso posterior.Con este fin se guarda en bolsas de plastico y se somete a congelación rápida. El mayor rendimiento en aceite esencial se dá en el momento de la completa floración.

Cuando se utilizan para aromatizar guisos, sopas, verduras ó estofados, las hojas deben añadirse en el último momento, pues la cocción destruiría su aroma. Las semillas y las hojas se introducen en vinagre para preparar el vinagre de eneldo, con el cual se conservan pepinillos y otros encurtidos.